所以按理说，这件事德川家光还是要第一时间上报给自己的父亲大御所德川秀忠的，让德川秀忠亲自来拿主意。
可偏偏此时的大御所德川秀忠病重，已经奄奄一息了，万一听到了这样的噩耗，又如何能承受得起，还不得直接归西？
所以德川家光是想把此事压下来，暂时不去告知德川秀忠的。
可德川秀忠在隐居之地西之丸是有自己的幕僚机构的，他也正是以此来在幕后掌握实权的。
如今出了这么大的事情，德川家光这个没有实权的将军，想要瞒住德川秀忠这个“太上皇”又怎么可能呢？
很快，德川秀忠的亲信大臣土井利盛便将此事告知了德川秀忠，德川秀忠得知此事之后，虽然十分震惊，但是情绪却是异常的稳定，表现得格外冷静，沉默了许久的德川秀忠也只是吩咐土井利盛去把德川家光召来见自己，却并没有多说其他。
在德川家光赶来之前，德川秀忠一言未发，直到他见到了德川家光之后，才终于再次睁开了双眼，望着德川家光，一字一句地嘱咐道：“家光，接下来你就是真正的德川家第三代征夷大将军了，你要始终铭记一件事，那就是切莫自不量力，效仿丰臣秀吉与明国开战！”
说完这话，德川秀忠便再也无力言语了，变得意识模糊，缓缓闭上了双眼，陷入了昏迷。
德川家光望着昏迷的父亲，眼中也不禁布满了泪光，只是他还是无法理解父亲最后告诉自己的这句话，到底是什么意思，为什么父亲对于长崎海战惨败一事只字未提，也没有说接下来如何对付那伙儿海盗的事情，反倒嘱咐自己不要与明国开战呢？
但是如今德川家光也已经无心再去仔细琢磨这件事了，在西之丸守了一个昼夜之后，二代幕府将军德川秀忠终于彻底撒手人寰，一命呜呼。
接下来，德川家光须得忍住悲痛，正式将幕府的实权从他父亲的手中接过。
德川家光在赶来西之丸的时候，就已经想到了这样的结果，已经知道这可能是自己来见父亲最后一面了，而接下来他也将正式将幕府的实权接到自己的手中，故而也是提前做好了充分的准备。
一方面处理着德川秀忠的后事，德川家光一方面开始重组自己的幕府构架，他任命自己的六位侧近，松平信纲、堀田正盛、三浦正次、阿部忠秋、太田资宗和阿部重次为“六人众”。
并设立了老中、若年寄、奉行、大目付、目付等职务，对幕府的职责权限进行了全新的调整和规范，新的幕府政治体系至此便被德川家光完全建立了起来。
德川家光掌权之后的第一件事，自然是要解决长崎海战的善后问题，幕府之中对此也是产生了两种不同的声音。
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