但倭国幕府通过此次长崎遇袭，也稍微清楚了一些对付的实力，他们很清楚仅凭倭国一己之力，恐怕还是很难将其剿灭的。
要动员沿海各藩的水兵，进行一次大规模的海战，对于现任幕府将军德川家光和幕府的实际掌控者大御所德川秀忠来说，是一个难以做出的抉择。
经历过漫长的战国时代，丰臣秀吉又曾两次入侵朝鲜，事到如今倭国能做为战斗力的人数已经越来越少了，国力也还没有得到完全恢复，不到迫不得已，他们是不想劳师动众的。
所以倭国幕府最终还是把目光投向了郑芝龙，毕竟郑芝龙的产业也主要集中在长崎，他郑芝龙也是此次长崎遇袭的受害者，难道他就能容忍袭击长崎的凶手，逍遥法外吗？
上次他的船队被对付打得全军覆没的仇还没报，如今更是新仇旧恨加在一起，若是郑芝龙再不做出反击，他恐怕是要颜面扫地，以后都没法儿在这片海上混了吧！总而言之，倭国幕府此次派人去见郑芝龙，可以说是对其抱有很大期待的，而且事实上，不管倭国幕府愿不愿意承认，倭国的海上贸易，甚至海上战争，一直以来都对郑芝龙十分依赖。
郑芝龙早年是在倭国起家，在倭国本就颇有权势，而后其自立门户，郑氏更是逐渐成为了大明东南沿海最大的海商集团，郑芝龙在倭国的权势和地位自然也是水涨船高，各藩藩主与地方权贵也争相与之交游。
平户藩能够成为倭国对外贸易中心，很大程度上都是依靠郑芝龙的经营，他善于外交，熟悉海外情况，又拥有庞大的海上势力，整个倭国也没有能出其右者，倭国幕府自然对其十分重视，尽心笼络。
而倭国幕府越是重视郑芝龙，郑芝龙在倭国的权势便越大，郑芝龙的权势越大，倭国幕府自然也就对他的依赖越深。
而对于郑芝龙来说，要维持自己在倭国的产业，与倭国幕府保持良好的关系自然是至关重要的，所以面对倭国幕府的来使，他还是不敢怠慢的。
再者说，即便是倭国幕府不派人过来与其商议剿灭这伙“海盗”之事，郑芝龙也已经是忍无可忍了，在此之前他为了等待大明朝廷的回声，已经暂停了长崎方面的事务，可他哪曾想对方竟然还敢公然袭击倭国本土，炮轰长崎！
倭国幕府的猜想确实是正确的，如今人家都已经骑到郑芝龙的头上拉屎了，若是郑芝龙还连个屁都不放，那么以后他也就不用混了，颜面扫地不说，以后恐怕也难以服众，谁也不会再把他郑氏放在眼里。
不过事儿虽然是这么个事儿，但郑芝龙也绝对不是一个意气用事之人，他心中恼怒是不假，但却依然保持着绝对的理智。
他看得出来，现在倭国幕府派人来找自己，虽然口上说着是让他协助幕府剿灭海盗，但实际上恐怕是要把自己当刀使，要利用自己为他倭国除害。